竹千户所，第二联队负责宜兰千户所，近卫师团的两个大队负责桃园千户所，在占领并完全肃清这些地区的敌对土著民后，第一旅团正式转为台北卫警备旅团，组织当地汉民和亲近土著民恢复生产生活，为随后的台南、台中“扫荡”提供有力支援。
作战计划下发后，第一旅团便磨刀霍霍。与此同时，居住在台北卫各地的野人土著民收到了明军的通知，命令这些部落即刻派员同就近明军接触，接受明军指挥，登记户口黄页，并领取他们的身份证明。
身份证明为一纸写有姓名，年龄，籍贯地址的黄纸，基本和明朝百姓所持有的黄页相同，但却多了一个民族栏目。
根据魏公公的指示，民族一栏统一填写为汉族。即凡自愿接受大明统治的部落，无论之前是什么番，什么人，从今往后一律为汉人。
成为汉人后，土著民便享受明军的保护，也享受皇明百姓所享有的一切待遇，同时也承担向大明纳税的义务。
福建巡抚黄承玄听说此事后，颇有疑虑，致信魏公公称野人土著民不服王化，不懂汉字，不说汉话，其部落又大小数十个，习俗更是不同，若强硬将他们定为汉民，使他们改姓改俗，是否会激起土著民的反抗，凭添无谓伤亡？
黄中丞意不若以所在地区为民，称何地人，如住高山之上便为高山人，住丘谷之中便为丘谷人，只要他们不强硬反抗官兵，便可视情况给予一些尊重和照顾。这样想来不但可以得到土著民的支持，也能不致朝堂弹劾。
魏公公却道：“今岛上汉少土多，土汉矛盾又积百年，此我三省联兵登岛，便为永久纳台湾于我皇明版图之内。如此，则岛民必须尽使其服我明治，教其汉话，汉俗，使岛民尽如我汉人一般，此才为长治久安之道。
否则，他日若有动荡，则尽曰我非汉人，与尔汉人非同宗也非同种，汉人乃是外来者，东番之地非中国所有，鼓噪我汉人离
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