，对异己力量进行了排斥。原来和辽世宗关系近的大臣，或者罢官，或者不再重用。
比如耶律颓显，本来对他继承皇位立下了大功，辽穆宗也许诺他给本部大王之位，但因为耶律颓显老是念念不忘辽世宗对他的恩情，所以，穆宗很不高兴，给他大王的许诺也就束之高阁了。对于敢公开反对他，进行谋叛的人，穆宗也毫不手软地镇压。
除了镇压之外，耶律还禁止大臣们随便议论朝政。许多大臣就是因为议论朝政而被贬官、罢官的。穆宗虽然将这些叛乱都平息了，但无法从根本上杜绝这类事情的发生，反而为以后埋下了祸根。
在他即位不足一年，担任政事令的国舅肖眉古得和宣政殿学士李商议投奔后周，李给在后周做官的哥哥李涛写信，说契丹的君主不好，只知道喝酒游猎，没有大志向，建议后周用兵。最后事情泄露，肖眉古得被杀，李被处以杖刑。事情刚刚平息，在七月，辽世宗的弟弟耶律娄国又想自立为帝，被穆宗绞杀，同谋耶律敌猎被凌迟处死。
九百五十三年的十月，李胡的儿子耶律宛也来争夺皇位，还涉及到了自己的弟弟，连原来世宗的重臣耶律安搏也牵连在内，结果，安搏死于监狱中，其他人被处死，而弟弟和耶律宛却被释放了。这和他的父亲辽太宗惩罚反叛的兄弟一样，没有像汉族兄弟间的争夺基本都是残杀为结果的。
九百五十九年十一月，四弟弟敌烈主谋反叛，被平息后，和上次一样，其他人被杀，敌烈却被释放了，为了警示众人，穆宗还专门进行大规模的祭祀天地祖先，说明自己的才是合法的继承人。
没有过多久政事令耶律寿远和太保肖阿不等人谋反，最后都被处死，一个月之后又发生李胡儿子耶律喜隐的叛乱。穆宗将李胡父子都抓进了监狱，他的皇帝位置终于是坐稳了，反对他的人都已经或死或被抓起来了。
他这个时候应该仰天长啸，不过历史跟他开了一
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