古人的态度，决定采取主动联合的策略，企图在保全自己实力的同时，借阿尔斯兰的兵力消灭格鲁派。噶玛噶举派红帽系活佛却吉旺秋作为藏巴汗一方的代表赶到当雄，与阿尔斯兰达成了一项协议，“决定由萨当巴占据拉萨、拔绒巴占据热振，彻底消灭格鲁派，做噶玛巴和主巴噶举派的施主”。
与藏巴汗的反应截然不同，格鲁派一方对这一事件表现得极为冷静。当时，五世达赖喇嘛正在哲蚌寺附近的格培寺闭关修行，当达东仲尼向强佐索南热丹报告了这一“惊天动地的事件”后，五世达赖喇嘛冷静地分析了形势，认为“蒙古人不会很快来到拉萨”，仍然坚持闭关修行。事件的发展果然如五世达赖喇嘛所料，阿尔斯兰的军队直到崇祯十七年初才进驻拉萨，进入拉萨之后不久，此人反而被达赖的个人魅力征服，又信仰了黄教，其后又导致了一系列的变化，拉萨被固始汗占领，藏巴汗和他的红教政权灭亡。蒙古人和西藏人的争斗最终使卫拉特人趁虚而入，使西藏和大半个新疆包括青海一带，还有原本的卫拉特人占据的中亚地区都成为葛尔丹汗国的一部份，葛尔丹汗国极盛时有七百万平方公里的土地，不是人们想象中的就是一个蒙古部落而已。
从清初到乾隆年间，卫拉特人的葛尔丹汗国部一直与清朝厮杀不停，清政府是用了超过百年的时间来梳理青海到西域故地和西藏，从康熙初年漠北的争斗到乾隆年间争夺新疆和西藏，最终在青海把十万准部男丁全部杀戮干净，这一场大规模的，与宗教教派和国土有关的绵延百年以上的战争才终于结束了。
张瀚对具体的过程记不太清楚了，不过却图汗这颗钉子是始终要拔除的，不要说这人如果南下的话会对青海的局势包括整个套部和土默特西边的局面造成不好的影响，就是为了安定漠北，这一仗也是非打不可。
没有考虑太久，张瀚就道：“请诸位放心，半个月之内，我们会出兵西向，解决却图汗部
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